目的 探讨白细胞介素1α(IL-1α)基因单核苷酸多态性(SNP)与甲型H1N1流感易感性的关系。方法从IL-1α基因启动子区域中选取4个SNP位点rsl800587、rs2856836、rs2856838、rs3783525,针对以上位点建立基于飞行时间质谱分析技术(TOF—MS)鉴定SNP的方法,对167例H1N1流感患者(H1N1组)和192例健康对照人群(对照组)进行检测。确定各SNP位点的等位基因和基因分型;对比两组等位基因和各基因型的频率。结果rsl800587、rs2856836、rs2856838位点具有T和C两种等位基因,包括Tr、TC、CC3种基因型。rs3783525具有A和T两种等位基因,包括AA、AT和Tl 3种基因型。HINl组和对照组rsl800587位点的等位基因频率差异有统计学意义(X2=12.69,P=0.000,OR=2.424,95%CI=1.472~3.993),rs2856836,rs2856838,rs3783525等位基因频率在H1N1组和对照组中差异则无统计学意义。H1N1组rsl800587位点CC纯合子频率低于对照组[72.5%(121/167)比87.0%(167/192),P〈0.05],杂合子(TC)频率高于对照组125.1%(42/167)比12.5%(24/192),P〈0.05],而两组Tr纯合子频率差异则不具有统计学意义。H1N1组rs2856836位点杂合子(TC)频率高于对照组[25.7%(43/167)比17.2%(33/192),P〈0.05],TT基因型与CC基因型频率在两组间差异均没有统计学意义。rs2856838位点对照组TT纯合子频率低于H1N1组[4.2%(8/192)比10.8%(18/167),P〈0.05],其余2种基因型Tc与cc在两组间差异没有统计学意义。H1N1组rs3783525位点TT纯合子频率高于对照组[21.0%(35/167)比13.0%(25/192),P〈0.05],两组间的另两种基因型TC与cc差异也没有统计学意义。结论IL-1α仅基因多态性位点rsl800587、rs2856836、rs2856838、rs3783525与甲型H1N1流感易感性相关。
白细胞介素1仪基因单核苷酸多态性与甲型H1N1流感易感性的关系
【摘 要】
:
目的 探讨白细胞介素1α(IL-1α)基因单核苷酸多态性(SNP)与甲型H1N1流感易感性的关系。方法从IL-1α基因启动子区域中选取4个SNP位点rsl800587、rs2856836、rs2856838、rs3783525,针对以上位点建立基于飞行时间质谱分析技术(TOF—MS)鉴定SNP的方法,对167例H1N1流感患者(H1N1组)和192例健康对照人群(对照组)进行检测。确定各SNP位点
【机 构】
:
广州医学院第一附属医院检验科,510120,深圳市第三人民医院肝病研究所,深圳市第三人民医院肝病研究所,深圳市第三人民医院肝病研究所,深圳市第三人民医院肝病研究所,深圳市第三人民医院肝病研究所
【出 处】
:
中华生物医学工程杂志
【发表日期】
:
2013年19期
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