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根据三塘湖盆地区域构造及重力、磁力、电性特征，提出了盆地基底有双重结构的看法，深层基底是由前寒武纪古老结晶基底与西部另一地体或陆缘碎块及洋壳残片的拦接而成，之后又叠另了以海西期火成岩为诉浅层褶皱基底。基底结构的这种双重性明显影响着盖层的构造特征；盆地东部由于存在深层刚性基底，抑制了盖层的后期构造变化，在盖层中往往形成大面积的宽缓的构造圈闭；盆地西部由于不具刚性基底，盖层中往往线性褶皱和断阶、断块；