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利用SSR分子标记技术对72份甜瓜种质资源及育种材料进行DNA指纹分类及亲缘关系研究,20对SSR引物共扩增产生76个多态性位点,平均每对引物产生3.8个多态性位点。聚类结果将72份甜瓜种质资源分为7个类群,其中类群I包括新疆本地资源及几乎全部自育甜瓜种质资源64份材料,这说明本试验所选用的新疆厚皮甜瓜种质资源遗传背景比较狭窄。