【摘 要】
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WRKY转录因子家族属于一类广泛参与植物生长发育调控,以及各种生物和非生物胁迫下植物防御应答反应的转录因子.通过HMMER 3.0软件,在土豆基因组中进行WRKY转录因子的比对搜索
【机 构】
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四川大学生命科学学院/生物资源与生态环境教育部重点实验室水力学与山区河流开发保护国家重点实验室; 合肥工业大学生物与食品工程学院;
【基金项目】
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国家杰出青年科学基金项目(30825030);国家自然科学基金项目(31171179);博士点优先资助项目(20110181130009)资助~~
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WRKY转录因子家族属于一类广泛参与植物生长发育调控,以及各种生物和非生物胁迫下植物防御应答反应的转录因子.通过HMMER 3.0软件,在土豆基因组中进行WRKY转录因子的比对搜索和鉴定.系统分析鉴定得到81个土豆WRKY转录因子,被划分为3个大组:Ⅰ组、Ⅱ组和Ⅲ组.Ⅱ组进一步划分为5个亚组:Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e.土豆、拟南芥和水稻的WRKY基因的系统进化树揭示出:土豆和水稻基因组中分别发生了物种特异的WRKY基因扩增事件,其中Ⅱ-e组中发生了土豆基因组中特有基因扩增.同组中的WRKY成员蛋白序列中的氨基酸保守域构成基本一致.各个分组成员的氨基酸保守域组成特异;但共有的保守域区段在各个分组中仍然存在.在受伤、干旱、盐以及病毒侵染胁迫条件下,28个土豆WRKY转录因子基因的表达模式被阐明;其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,很可能参与了调控土豆逆境胁迫条件下的防御应答反应.
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