【摘 要】
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为研究马铃薯冷驯化机理,通过同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and abso-lute quantification,iTRAQ)分析了冷驯化过程中(0,4和12 d)马铃薯野生种Solaum acaule (W3,具备冷驯化能力)和S.cardiophyllum (Cph12,无冷驯化能力)的蛋白质组变化.结果 表明,在W3和Cph12中筛选的可信蛋白质数量分别为2126和1044;在冷驯化早期分别筛选到103与56个差异表达蛋白,后期分别筛选到330
【机 构】
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贵州省农业科学院生物技术研究所,贵阳,550006
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为研究马铃薯冷驯化机理,通过同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and abso-lute quantification,iTRAQ)分析了冷驯化过程中(0,4和12 d)马铃薯野生种Solaum acaule (W3,具备冷驯化能力)和S.cardiophyllum (Cph12,无冷驯化能力)的蛋白质组变化.结果 表明,在W3和Cph12中筛选的可信蛋白质数量分别为2126和1044;在冷驯化早期分别筛选到103与56个差异表达蛋白,后期分别筛选到330和155个;富集到与耐寒性或冷驯化直接相关的途径27条,例如膜脂质成分的调节,渗透保护剂的合成,抗氧化代谢,能量代谢和光合作用等.本研究结果为深入研究马铃薯冷驯化的分子机制提供理论指导,也可为马铃薯抗寒基因挖掘及分子育种提供参考.
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ABC转运蛋白是一类广泛存在于原核和真核生物中的跨膜运输蛋白,参与植物信号转导、次生代谢物运输和非生物胁迫响应等过程.本研究基于八仙花转录组数据,利用生物信息学分析方法对铝胁迫下ABC转运蛋白基因家族成员、理化性质、基因结构、系统发育以及基因表达模式进行分析.结果表明八仙花ABC转运蛋白基因家族包括48个成员,分别属于7个亚家族,其中C亚家族成员最多;亚细胞定位结果显示50％的家族成员位于质膜上;理化性质和结构域分析显示绝大多数为疏水性蛋白,不同亚家族均具有特异的保守基序,但是motif 1和motif2
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