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紫萁小菇与天麻种子共培养时可刺激种子萌发形成原球茎。菌丝自胚柄端柄状细胞侵入天麻种子原胚，分布于天麻原球茎基部的柄状细胞，外 皮层细胞和内皮层细胞内，菌丝外围环绕着一层原球茎细胞质膜和电子透明物质，这一界面是原球茎与真菌相互作用的产物，两者间的物质转运发生在这个界面上。菌丝在外皮层细胞中形成菌丝结，在内皮层细胞中则被消化，形成扁化，衰败的菌丝或菌丝团块，含有衰败菌丝的原球茎细菌可被菌丝重新定植，新近定植的菌丝又被原球茎细胞消化。