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采用PCR产物直接测序技术对56头沼泽型水牛和26头河流型水牛Y染色体性别决定基因（SRY）的完整编码区及部分侧翼区序列进行了测定和比较分析，结果显示所有沼泽型水牛的SRY基因编码序列一致，所有河流型水牛的SRY基因编码序列也一致；但沼泽型水牛和河流型水牛之间SRY基因编码区序列相比在c．202位点存在一个G〉C替换，这个碱基差异属于错义突变，导致了p．G68R，即编码的第68位氨基酸在沼泽型水牛为甘氨酸G，而在河流型水牛为精氨酸R；经群体检测确定SRY基因C．202G〉C变异为沼泽型水牛和河流型水牛之间