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从野生黄芩的根、茎、叶中分离出97株内生真菌,其中33株来自生长期植株,64株来自成熟期植株。经分类鉴定,隶属于38个属,优势属为Alternaria,成熟期的属种多样性高于生长期。将其中的95株内生真菌对14种指示菌进行抑菌试验,发现其中91株内生真菌对一种或多种指示菌具有抑菌活性,占分离菌株总数的95.8%。野生黄芩内生真菌对大肠杆菌CGMCC1.1103、枯草芽孢杆菌CGMCC1.769、蜡样芽孢杆菌ATCC1361、致病性大肠埃希氏菌ATCC49105、白色假丝酵母ATCC10231、小孢拟盘多毛孢CNUMB2PM01等6个指示菌菌株抑菌效果较好;对单核细胞增生李斯特菌ATCC27708、普通变形杆菌ATCC33420、肠炎沙门氏菌ATCC14208、副溶血型弧菌ATCC27519、宋内氏痢疾杆菌ATCC51060、九州镰孢霉CNUMB2FK01等6个指示菌菌株抑菌效果较差;对深红酵母CGMCC2.282和金黄色葡萄球菌ATCC12600没有抑制作用。