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目的与意义：番茄红素是重要的天然类胡萝卜素，对人体具有保健作用，同时也是红色果肉西瓜中的主要色素，是决定西瓜果实品质的重要因素之一。栽培西瓜较低的DNA多态性阻碍了高质量遗传图谱的构建和番茄红素含量主效QTL的研究。该研究中，笔者成功地利用自行开发的CAPS标记构建了一个包含16个连锁群的西瓜遗传连锁图谱，该图谱将有利于西瓜果肉番茄红素含量关键基因确定及其克隆的进一步研究，同时为西瓜果肉番茄红素含量分子育种提供行之有效的分子标记。
材料和方法：以红色果肉西瓜自交系‘LSW-177’（雌雄同株，外皮深绿色具有深绿色条纹，果实长圆形;中心可溶性固形物含量为7%，边缘为5.5%）和浅黄色果肉西瓜自交系‘Cream of Saskatchewan’（简称‘COS’，雌雄同株，外皮绿色具深绿色条纹，果实球形;中心可溶性固形物含量为10%、边部8.6%）为亲本，配制F1代并自交及回交获得F2代及BC1P1、BC1P2群体。利用449对西瓜SSR标记（包括23对核心西瓜SSR标记）和556对甜瓜SSR标记在群体中进行筛选。使用Illumina HiSeq 2000高通量测序平台对两亲本进行基因组DNA重测序，运用生物信息学进行SNP位点分析，选择11种限制性内切酶（EcoRI，BsaHI，HindIII，MboII，PstI，ScaI，BamHI，MluI，AluI，DraI和PvuI）对候选SNP位点进行分析，开发CAPS标记;利用高效液相色谱法（HPLC）对F2代单株果肉进行番茄红素含量测定;使用IciMapping V3.3软件，对筛选获得148个多态性标记（40个SSR标记和108个CAPS标记）和234个F2代单株构建遗传连锁图谱构建及QTL分析。
结果与分析：（1）通过对西瓜六世代群体的果肉颜色及番茄红素含量进行遗传分析，西瓜红色果肉为单隐性基因遗传，F1 代果肉呈现出接近于父本的亮黄色，F2代中非红色组（亮黄色 浅黄色）∶红色组符合3∶1的遗传比例（p
材料和方法：以红色果肉西瓜自交系‘LSW-177’（雌雄同株，外皮深绿色具有深绿色条纹，果实长圆形;中心可溶性固形物含量为7%，边缘为5.5%）和浅黄色果肉西瓜自交系‘Cream of Saskatchewan’（简称‘COS’，雌雄同株，外皮绿色具深绿色条纹，果实球形;中心可溶性固形物含量为10%、边部8.6%）为亲本，配制F1代并自交及回交获得F2代及BC1P1、BC1P2群体。利用449对西瓜SSR标记（包括23对核心西瓜SSR标记）和556对甜瓜SSR标记在群体中进行筛选。使用Illumina HiSeq 2000高通量测序平台对两亲本进行基因组DNA重测序，运用生物信息学进行SNP位点分析，选择11种限制性内切酶（EcoRI，BsaHI，HindIII，MboII，PstI，ScaI，BamHI，MluI，AluI，DraI和PvuI）对候选SNP位点进行分析，开发CAPS标记;利用高效液相色谱法（HPLC）对F2代单株果肉进行番茄红素含量测定;使用IciMapping V3.3软件，对筛选获得148个多态性标记（40个SSR标记和108个CAPS标记）和234个F2代单株构建遗传连锁图谱构建及QTL分析。
结果与分析：（1）通过对西瓜六世代群体的果肉颜色及番茄红素含量进行遗传分析，西瓜红色果肉为单隐性基因遗传，F1 代果肉呈现出接近于父本的亮黄色，F2代中非红色组（亮黄色 浅黄色）∶红色组符合3∶1的遗传比例（p