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为了明确抑制基因CyP81A6的表达对水稻的自身功能基因表达的影响，对亲本水稻秀水110和转基因水稻450—3的mRNA进行深度测序，并将获得的序列信息通过水稻基因数据库和生物信息学手段进行注释和功能基因比较。结果表明，在3529个差异表达的基因中，上调表达基因1018个，下调表达基因2511个；秀水110与450—3中共同表达的基因有2533个，仅在450—3中表达的基因有363个，仅在秀水110表达的基因有633个。与水稻基因数据库功能已知的296个抗性基因对比，发现450—3中差异表达的基因有64个