腔肠动物Rho-GDI的生物信息学分析

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目的 分析海葵、珊瑚、水螅的Rho-GDI结构与功能的关系,为推测其他腔肠动物Rho-GDI的结构与功能提供理论依据和方法指导.方法 利用在线生物信息学软件对海葵(Nematostella vectensis)、珊瑚(Acropora millepora)、水螅(Hydra magnipapillata)的Rho-GDI的氨基酸残基组成、理化性质、结构、功能和相似性等进行分析.结果与结论 Rho-GDI蛋白为一类定位于细胞质的可溶性蛋白,其氨基酸残基组成和理化性质相似,不含信号肽或跨膜结构域,但含有多个磷酸化和糖基化位点;其N-端疏水区富含α-螺旋和卷曲螺旋,β-折叠散布于整个蛋白质中.推测这些结构可能与GDI蛋白具有的转录调节、应激反应等功能相关.多重比对表明,来源不同的Rho-GDI相似性较高,结构上具有高度保守性.
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