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多种快速发展的应用产生了海量的数据,使得数据结构多样化,导致在异构数据库系统中数据的存储和查询方式不统一。文章设计了基于分层思想的异构数据库的海量数据查询系统,提出查询分发策略并通过Map Reduce并行计算实现了海量查询子结果的汇聚,最后对该系统的有效性进行测试,结果表明:系统实现了统一数据格式的联机查询目标,性能表现良好,提升了查询的精度和效率。