【摘 要】
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基于印度谷螟转录组测序数据筛选其功能微卫星（EST-SSR）分子标记,设计该虫的微卫星（SSR）引物并验证其适用性。用MicroSAtellite微卫星搜索软件查找印度谷螟转录组中微卫星的数量
【机 构】
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南京财经大学食品科学与工程学院/江苏省现代粮食流通与安全协同创新中心,草地农业生态系统国家重点实验室/兰州大学草地农业科技学院
【基金项目】
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粮食公益性行业科研专项(201413007-2,201513002-5-3);国家重点研发计划专项(2016YFD0401004-04);江苏省高校优势学科建设工程
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基于印度谷螟转录组测序数据筛选其功能微卫星（EST-SSR）分子标记,设计该虫的微卫星（SSR）引物并验证其适用性。用MicroSAtellite微卫星搜索软件查找印度谷螟转录组中微卫星的数量、重复次数以及所有微卫星的位置信息,采用Primer Premier 5软件设计SSR引物,并进行PCR验证。结果表明含EST-SSR的序列3 173个,占总搜索序列的8.52%,平均每13kb中就出现1个EST-SSR。共发现192种微卫星类型,其中重复单元为单碱基、二碱基和三碱基的比例较高,依次是28.21%、3
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