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金玉樱桃番茄富含蛋白质，钾、钙等多种矿物质和微量元素硒及丰富的胡萝卜素、多种维生素、柠檬酸、苹果酸等，其中维生素C含量大大高于普通番茄，成熟果实含糖量高达9％～10％，风味独特，具有较高的营养价值。此外樱桃番茄在医疗保健上也有重要作用，其果汁中含甘汞，具有利尿保肾功能；果皮茸毛能分泌芦丁，芦丁与维生素E作用相同，能降低血压，预防脑溢血、动脉硬化。