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高致病性禽流感和新城疫都是由病毒引起禽类高度传染性疾病，在我国被列为一类传染病。二者具有危害严重、发病率和死亡率高、临床特征相似等特点，文章从血清学、分子生物学等方面介绍了可用于二者的鉴别诊断方法，尤其是PCR，基因芯片法、M检测法等先进的分子生物学技术，为有效鉴别高致病性禽流感和新城疫提供参考。