2个银叶真藓HSP70序列的生物信息学相关分析

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：luohua0891

【摘要】

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从银叶真藓（Bryum argenteum）转录组数据库出发,使用Pfam数据库提供的HMM模型共得到33条长度大于200aa,注释的热休克蛋白BaHSP70;其中2条（BaHSP70-1,BaHSP70-2）具有完整ORF,NCBI

【作者】

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王明强高贝张道远

【机构】

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中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院大学

【出处】

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生物信息学

【发表日期】

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2015年1期

【关键词】

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真藓热激蛋白70 RNA-SEQ 生物信息学 Bryum argenteum Heat shock protein 70 RNA-Seq Bioinforma

【基金项目】

：

NSFC-新疆青年人才联合项目（U1403302）.

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从银叶真藓（Bryum argenteum）转录组数据库出发,使用Pfam数据库提供的HMM模型共得到33条长度大于200aa,注释的热休克蛋白BaHSP70;其中2条（BaHSP70-1,BaHSP70-2）具有完整ORF,NCBI核酸数据库登录号为KP087877和KP087878。使用生物信息学在线分析工具和软件,对真藓HSP70的两条蛋白质序列从氨基酸组成、保守结构域、理化性质、疏水性/亲水性、信号肽、蛋白质结构、模体的识别及同源性分析等方面进行了预测和分析。结果表明：2条BaHSP70s基因序列

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