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以COHERENS模型为基础，建立了长江下游感潮河段三维水流及污染物质输运数学模型，该模型通过口坐标变换，使整个水域垂直方向可采用相同的分层。基于模态分裂法，将三维流动分成表面重力波（外模式）和内重力波（内模式）；模型求解技术上采用算子分裂法，使用了superbee限制器TVD格式，减小非物理的数值虚拟震荡。选取长江常熟段为例，模型较好的模拟了感潮河段三维流场及污染带分布特征。该成果对感潮地区污染物输运规律及水污染控制具有指导意义。