基于TCGA数据库分析PFKFB4在肝细胞癌的临床意义及分子机制

来源 :分子诊断与治疗杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：vitchen02

【摘要】

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目的研究6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4(PFKFB4)在肝细胞肝癌(LIHC)中表达和甲基化与预后的关系,分析PFKFB4在LIHC恶性进展中的作用机制。方法从TCGA数据库下载LIHC

【作者】

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段怡平陈梁玥柳家翠黄奔程庆元马甜甜朱翠雯秦菲

【机构】

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武汉大学中南医院影像科,武汉大学中南医院检验科

【出处】

：

分子诊断与治疗杂志

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

肝细胞癌 PFKFB4 TCGA GSEA 甲基化 LIHC PFKFB4 TCGA GSEA Methylation

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81472033、30901308),湖北省卫生健康科研基金资助(WJ2019M203),武汉市应用基础研究(2017060201010171),湖北省卫生和计划生育委员会联合基金项目(WJ2018H0028),湖北省卫生和计划生育委员会青年人才项目(WJ2015Q021),武汉大学中南医院科技创新培育基金(cxpy2018031、cxpy20160054),武汉大学大学生创新项

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目的研究6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4(PFKFB4)在肝细胞肝癌(LIHC)中表达和甲基化与预后的关系,分析PFKFB4在LIHC恶性进展中的作用机制。方法从TCGA数据库下载LIHC的RNA-seq数据和临床信息,分析比较PFKFB4在LIHC样本和正常样本中的表达差异,利用卡方检验分析PFKFB4与患者临床特征的关系。通过Kaplan-Meier法和Cox风险回归分析PFKFB4在LIHC中的预后价值。利用基因富集分析(GSEA)探索PFKFB4参与的分子通路,并通过MethSur

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