一株烟碱降解细菌LN-1的分类鉴定及全基因组分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qianwenlong
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
菌株LN-1是从长期植烟土壤中分离出的一株能够高效降解烟碱的菌株。为了进一步阐明该菌株的降解机制,本研究对其进行了全基因组序列的测定,获得了菌株LN-1的全基因组序列。通过基于16S rRNA基因序列的系统发育分析以及平均核苷酸一致性分析,将菌株LN-1鉴定为放射形农杆菌(Agrobacterium radiobacter),确定了菌株LN-1的分类地位。通过对基因组分析发现,菌株LN-1参与烟碱降解代谢的基因簇定位于线状染色体2上。同时,LN-1的染色体2上还含有降解对羟基苯甲酸的基因簇,该基因簇包含了与已知对羟基苯甲酸降解基因(pcaG、pcaH、pcaC、pcaQ、pobA、pcaR、pcaI、pcaJ、pcaF、pcaB、pcaD、pobR)相似的基因,基于此本研究还验证了菌株LN-1降解对羟基苯甲酸的能力。菌株LN-1同时具有降解烟碱和对羟基苯甲酸的能力,可针对烟田特殊环境发挥作用,一方面可以改善植烟土壤微生态结构,另一方面可以缓解长期植烟造成的连作障碍。
其他文献
叶面积是影响植物光合作用、蒸腾作用、呼吸作用及产量形成的重要形态指标之一,为实现作物叶面积准确、稳定和无损化测量,该研究基于红外线成像设备,提供了一种利用热红外和可见光图像测定棉花叶片面积的方法。以苗期棉花作为研究对象,通过红外成像相机T660获取棉花的热红外和可见光波段的图像,分别使用GrabCut算法和Hough圆检测提取红外图像中叶片和可见光图像中已知实际面积的圆状参照物(五角硬币)的像素面
在传统小学语文教学中,教师经常要求小学生进行课文阅读,理论上通过该方法可以使学生的语言文字应用能力得到提高,但实际上大多数小学生只是参与式的阅读,其语言文字应用能力并没有得到多大的提高,说明传统教学方法存在缺陷。对此本文在小学语文阅读教学中,提出语言文字训练教学方法,并对该方法的运用进行分析。
期刊
在小学语文教学中,阅读是重要内容,在阅读训练中,教师不仅要指导学生进行课文的朗读,还要教导学生通过阅读来理解文中的一些词句,体会文章所表达的思想感情,深度理解文章。因此,在小学语文的阅读教学中,教师要注重语言文字的训练,加强学生对文字的理解,提升学生的语言应用能力。本文探析了小学语文阅读教学中语言文字训练方法,从五点进行了论述,分别是初读课文,理清脉络;赏析词句,探究语言;品读感悟,学以致用等。
植株计数是农民、育种专家等在整个作物生长季评估作物生长状况和管理实践的最常用方法之一,可用来进行合理的田间规划以及管理。针对高密度种植试验区高通量获取玉米自动株数方法匮乏的问题,本研究利用无人机遥感平台,获取田间314个不同基因型的玉米高密度育种小区的数码影像和激光雷达(light detection and ranging, LiDAR)点云数据,发展了一种结合玉米三维空间信息的固定窗口局部最大
随着受众对非遗博物馆的体验诉求日趋强烈,展示空间的体验设计成为非遗博物馆发展的必然趋势。非遗博物馆作为文化传播与传承的主要空间,其单一的展示形式难以满足受众对文化体验的需求。文章通过结合体验设计的理念与展示空间的设计策略,从非遗博物馆的体验维度进行归纳与分析,进而构建符合用户体验诉求的非遗博物馆展示空间体验设计策略。
期刊
为实现烟草拟茎点霉的快速准确检测,利用真菌rDNA-ITS通用引物对拟茎点霉和其他10种烟草病原菌基因组DNA进行了PCR扩增、片段回收及DNA测序,在序列比对基础上设计了两对特异性检测引物,并鉴定了引物的检测灵敏度和特异性,同时优化建立了PCR反应体系。结果表明,在退火温度为60 ℃时,两对特异性引物P2F/P3R和P3F/P3R从烟草拟茎点霉DNA样本中分别扩增出来420 bp和381 bp的
深拖和AUV调查是深水工程勘察主要作业方式,精确确定深拖拖体、AUV在水下的位置对深海工程勘察作业至关重要。目前水下定位多采用声学导航定位,其中超短基线定位系统因其结构简单、操作便利、测距精度高、成本低等诸多优势而广泛应用于深水工程勘察作业中。文章介绍了超短基线水下导航定位原理与系统组成,分析了超短基线定位影响因素及提升定位精度的方法。结合实例,阐述了超短基线在深拖与AUV深水工程勘察作业中的应用