【摘 要】
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目的 基于肺炎衣原体感染(Cpn)的非小细胞肺癌患者全基因组DNA甲基化与lncRNA-mRNA的表达情况分析,探索肺癌生物标志物.方法 收集6对Cpn感染非小细胞肺癌患者的癌与癌旁组织,
【机 构】
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福建医科大学附属第一医院,福建福州,350005;福建医科大学公共卫生学院,福建福州,350108
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目的 基于肺炎衣原体感染(Cpn)的非小细胞肺癌患者全基因组DNA甲基化与lncRNA-mRNA的表达情况分析,探索肺癌生物标志物.方法 收集6对Cpn感染非小细胞肺癌患者的癌与癌旁组织,进行全基因组DNA甲基化芯片、lncRNA/mRNA芯片分析,筛选差异甲基化基因、差异表达的lncRNA及mRNA,将3者联合分析并进行GO分析及KEGG通路分析.结果 共筛选出3 940个差异表达lncRNA,5 105个差异表达mRNA;得到11 306对lncRNA-mRNA共表达对.发现了115个差异甲基化基因,含24个DNA甲基化mRNA关联对.最终筛选35个lncRNA/DNA甲基化-mRNA关联对,包含6个差异基因,即ZIK1、FAM184、CHRN、CPLX、NAV2和SCUBE2.GO分析及KEGG通路分析发现筛选的差异基因功能与信号通路与肿瘤发生有关.结论 DNA甲基化与lncRNA共同调控mRNA表达状态,影响ZIK1、FAM184、CHRN、CPLX、NA V2和SCUBE2等基因的功能,进一步影响Cpn感染的非小细胞肺癌的发生发展.
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