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目的分析共聚焦内镜在消化系统疾病中的，临床诊断价值分析。方法我院于2010年5月至2011年5月选出50例患有消化系统疾病的患者进行实验观察，并将两组患者随机分为观察组和对照组，即A组与B组。使用共聚焦内镜对其消化系统进行诊断分析，从而得出准确数据。结果通过共聚焦内镜的诊断分析，发现观察组中诊断出患有胃癌、溃疡性结肠炎，以及胶原性结肠炎的患者概率数明显大于对照组，具有统计学意义。结论在消化系统诊断过程中应用共聚焦内镜技术能够取到良好的效果，而且其具备技术发展的意义，可能成为快速诊断肿瘤分子水平的关键技术。