【摘 要】
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首先阐述了分子对接设计的基本原理，然后在蛋白质受体中引入关键残基的概念，建立了一个新的柔性分子对接模型．以配体的中心坐标以及它和受体关键残基的旋转键角为设计变量，以设计
【机 构】
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大连理工大学电子与信息工程学院计算机科学与工程系,大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室,中国科学院上海药物所
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首先阐述了分子对接设计的基本原理，然后在蛋白质受体中引入关键残基的概念，建立了一个新的柔性分子对接模型．以配体的中心坐标以及它和受体关键残基的旋转键角为设计变量，以设计变量的尺寸为约束，通过最小化分子间相互作用能得到分子的最优取向和构象．一个自适应的遗传算法被用于求解上述优化模型，该算法采用多种群遗传策略、信息熵控制的空间减缩搜索技术以及拟精确罚函数方法，较好地平衡了效率与精度之间的关系，从而能够快速而稳定地逼近最优解．在此基础上，发展了新的精细分子对接程序，该程序可以进行受体与配体的柔性对接．药物分子对
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