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目前已发现250多种血型表位,且多数为整合于红细胞上的蛋白和糖蛋白。其中有些血型表位的功能已经明确:Diego(区带3)是红细胞阴离子交换通道;Kidd是尿素转运通道;Colton(水通道1)是水通道;Cromer(DAF)和Knops(CRI)是补体调节因子;Diego(区带3)和Gerbich(血型糖蛋白C/D)连接红细胞膜和膜骨架。Duffy糖蛋白是化学因子受体,用来清除外周血中的炎性介质,但也可以被间日疟原虫的裂殖子作为受体利用。某些血型抗原因与已知功能的蛋白和糖蛋白的结构相似,可推知其功能。例如:Lutheran、LW、和Ok糖蛋白都是受体和信号传导因子中免疫球蛋白超家族的成员,而Rh蛋白和相关的糖蛋白则表明与铵转运通道具有同源性,Kell糖蛋白则与内肽酶家族相似。然而,多数血型系统都存在与明显的病理学不相关的无效表型。如果这些血型抗原都具有重要功能的话,那么在它们缺失的情况下,别的结构肯定能执行它们的功能。至于血型多态性的生物学意义几乎还是一无所知。