【摘 要】
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目的利用生物信息学方法对年轻女性乳腺癌肿瘤组织及正常乳腺组织的差异表达基因进行筛选及分析,初步探索其相关分子机制。方法从癌症基因组图谱数据库(TCGA)下载年轻女性乳
【基金项目】
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国家自然科学基金面上项目(81972681),吴阶平医学基金会临床科研专项资助基金(320.6750.17191)
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目的利用生物信息学方法对年轻女性乳腺癌肿瘤组织及正常乳腺组织的差异表达基因进行筛选及分析,初步探索其相关分子机制。方法从癌症基因组图谱数据库(TCGA)下载年轻女性乳腺癌(≤35岁)相关转录组数据,其中包括29例乳腺肿瘤组织样本和3例正常乳腺组织样本。利用R语言Limma程序包筛选差异表达基因,进一步通过蛋白质相互作用数据库(STRING)构建差异表达基因编码蛋白质相互作用网络,着重对表达上调的核心基因进行生物学功能及信号通路分析。结果共筛选出720个差异表达基因,其中上调基因173个,下调基因547个。
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