基于Cytb及AFLP标记探讨仿石鲈科及相关科属分子系统进化关系

来源 :中国水产科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jiandande
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为从分子水平澄清我国仿石鲈科(Haemulidae)鱼类分类争议,研究测定分析了仿石鲈科及其相关科属共66种鱼类的线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)部分序列,结合AFLP标记信息,共同探讨仿石鲈科及相关争议科属系统分类关系.结果 表明,在Cyt b基因上,66种鱼类一致序列为729 bp,编码243个氨基酸;AFLP图谱中,6对引物组合共得到669条清晰条带,多态性条带669条,多态性比率100%.基于Cyt b基因利用最大似然法与AFLP标记基于UPGMA聚类法构建的系统进化树大致相同,进化树上,(1)仿石鲈科鱼类主要形成石鲈亚科(Haemulinae)与胡椒鲷亚科(Plectorhynchinae)两大分支,石鲈属(Pomadasys)、仿石鲈属(Haemulon)、异孔石鲈属(Anisotremus)等7个属聚为石鲈亚科分支,胡椒鲷属(Plectorhinchus)、少棘胡椒鲷属(Diagramma)与矶鲈属(Parapristipoma)3个属聚为胡椒鲷亚科分支.(2)髭鲷属(Hapalogenys)与眶棘鲈属(Scolopsis)没有与仿石鲈科聚在一起,髭鲷属独自形成一支,眶棘鲈属与金线鱼科(Nemipteridae)聚为一支.(3)鯻科(Teraponidae)的种类也没有与仿石鲈科鱼类相聚,鯻科与舵鱼科(Kyphosidae)、石鲷科(Oplegnathidae)存在更近的亲缘关系.对于仿石鲈科及相关科属的分类争议,研究支持仿石鲈科分为石鲈亚科与胡椒鲷亚科两个亚科,以及鯻科、眶棘鲈属、髭鲷属不应该归为仿石鲈科的观点.
其他文献
为研究绵羊输卵管功能相关的oar-miR-370-3p与抑制素亚基βB(inhibin subunit beta B,INHBB)、SMAD家族成员4(SMAD family member 4,SMAD4)和成纤维细胞生长因子18(fibroblast growth factor 18,FGF18)基因之间的靶向关系,本研究对多个物种(绵羊、人、小鼠、大鼠、猕猴、豚鼠和兔)中miR-370-3p的序列进行了比对,利用RNAhybrid程序预测绵羊miR-370-3p与INHBB、SMAD4和FGF18基因
本文描述了一种蟹类干制标本的制作方法。相比浸制标本,干制标本具有可定型、有效避免浸制液对人体的伤害和蟹类甲壳中色素的溶解等优点。具体方法为将蟹放入冰水混合物中麻醉后,用75%乙醇溶液从蟹的口部注射将其处死。在75%乙醇中浸泡24 h后,将蟹肢解成5部分(头胸甲、胸部腹甲、腹脐、螯足、步足或泳足)。使用2%胰蛋白酶溶液处理头胸甲6 h,用5%KOH溶液处理胸部腹甲24 h,以去除其甲壳内的肌肉组织。螯足、步足及泳足则需进一步肢解,然后手工剔除其中的肌肉。最后,将各部分用速干胶(德国产UHU)和锡丝按其原生位
试验旨在克隆延边黄牛二酯酰甘油酰基转移酶(diacylglycerol acyltransferase,DGATs)两种亚型(DGAT1和DGAT2)的CDS区核苷酸序列,并根据生物信息学对两种亚型的氨基酸序列进行分析,以及探讨其在延边黄牛各组织中的表达规律。采用RT-PCR和实时荧光定量PCR技术分别进行DGATs基因CDS区的扩增、克隆以及其在延边黄牛8个组织中mRNA表达量的检测,利用NCBI中BLAST将其与其他物种进行相似性分析,并构建系统进化树;通过在线工具对其编码蛋白的理化性质、一级结构及高
为探讨一株杀鱼假交替单胞菌2515 Pseudoalteromonas piscicida(简称菌株2515)在对虾养殖中的抗弧菌效果,以鳗弧菌(Vibrio anguillarum)为指示菌,以鳗弧菌的敏感抗生素新霉素
2019年7月,在非洲猪瘟防控期间,笔者偶遇某镇护林员巡山发现的2头死亡野猪。经现场剖检、采样和调查,后将病料送普洱市动物疫病预防控制中心兽医实验室检测非洲猪瘟病毒、猪瘟病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒,结果显示,非洲猪瘟病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒均为阴性,猪瘟病毒为阳性,确诊野猪因感染猪瘟野毒引起急性死亡。
为了掌握西藏牦牛摩拉氏菌的流行情况及耐药性,本试验在2018年9月从西藏林芝某县无菌采集牦牛眼拭子10份,对细菌进行分离纯化;并利用文献中所提及的该菌鉴定引物进行PCR检测。采用WHO推荐的K-B纸片法测定常用抗菌药物的敏感性。结果表明:从10份眼拭子样品中获得了1株牦牛摩拉氏菌。该菌株对12种抗菌药物产生了不同程度的耐药,对青霉素、头孢他啶产生耐药,对头孢氨苄、头孢曲松、卡那霉素和红霉素呈中介,对头孢唑啉、头孢呋辛、氨苄西林、新霉素、多西环素和庆大霉素较敏感。本试验分离鉴定西藏牦牛摩拉氏菌,并选用常用抗
本试验旨在研究产前运动对围产期奶牛生理代谢指标的影响,为围产期奶牛健康管理提供科学指导和理论依据。试验选取年龄相似,体况评分、胎次和预产期相近的经产荷斯坦奶牛24头,随机分为试验组(TRT组)和对照组(CON组),每组12头,统一饲养管理。于预产期前21 d开始,TRT组奶牛每日09:00和16:00以<3 km/h的速度运动1 h,每头奶牛每日总运动量为(4.0±0.2)km/d;CON组自由活动。分别在预产期前21、7 d、分娩当天及产后7、30 d(分别记为-21、-7、0、+7和+30 d)
试验通过测定不同日龄乳鸽嗉囊中鸽乳外观品质、能量蛋白质浓度、消化酶活性、免疫球蛋白水平及生长因子浓度,分析这些指标在乳鸽不同日龄的动态变化,旨在为系统了解乳鸽营养与生理需求提供理论依据。随机选择0、7、14、21、28日龄健康白羽王鸽乳鸽各12只,待亲鸽哺喂后屠宰,取出其嗉囊全部内容物。一部分用生理盐水稀释后取上清,用于消化酶活、免疫球蛋白及生长因子的测定;另一部分制成风干样用于常规营养水平的检测。结果显示,0日龄鸽乳外观呈乳白色油性奶酪样,7日龄鸽乳为奶酪样鸽乳和饲料的混合物,14日龄之后逐渐过渡为软化
Background:Due to presence of drug-resistant Eimeria strains and raised public health safety concerns about drug residues in the meat,there is renewed interest in the search for natural alternatives to the coccidiosis control agents.This study was conduct
试验旨在获得绵羊血小板源性生长因子D(PDGFD)基因的编码区(coding sequence,CDS)全长序列,并了解其在体内不同部位脂肪组织中的表达规律。以阿勒泰母羊和中国美利奴母羊为研究对象,克隆获得了PDGFD基因CDS区全长序列并对其进行了生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR方法对PDGFD基因在2个品种羊沉积在尾部、肠系膜、背部和肾脏周围4个不同部位脂肪组织中的表达水平进行定量分析。结果显示,绵羊PDGFD基因CDS区序列长度为1113 bp,编码370个氨基酸;PDGFD基因CDS区序列及