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以地高辛标记的Southern杂交技术已广泛应用于多个物种中。选择橡胶树为材料，就基因组DNA的提取、探针标记方法的选择以及具体的杂交操作过程等方面对该体系进行了优化。结果表明，至少40μg高质量的DNA在300μL的大酶切体系中，酶切12 h可获得良好效果；PCR法标记的探针杂交条带清晰、背景浅，其效率明显强于随机引物法标记的探针。本研究优化的体系信号强、背景浅和灵敏度高，为橡胶树Southern杂交鉴定分析提供参考。