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乳酸菌NICE系统的两组分食品级选择标记具有显性和互补选择标记的优点。含红霉素抗性选择标记的复制子缺失的伴生型质粒是依赖复制子完全且无选择标记的食品级克隆载体而复制的。构建的伴生型质粒的Emr和rep分别来源于pMG36e和pRAF800,经酶切、缺刻、补平和连接得到只能在红霉素选择压力下与θ型复制子的克隆载体共存的复制子缺失伴生型质粒。