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中祁连地块东段元古基底一般认为由３套地层组成，即古元古代湟源群、中元古代长城系湟中群和蓟县系花石山，三者之间皆为平行不整合关系。但新的研究表明：（１）花石山 与下伏的湟源群为角度不整合，结合新近发现的化石资料分析，认为药石山 是震旦纪－－寒武纪稳定盖层沉积，不应归于基底组成部分；（２）湟源群与湟中群为同一构造层，统称湟源群。