三株散发性戊型肝炎病毒变异株的部分序列比较

来源 :中国病毒学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jodan2008tw
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对三株散发性戊型肝炎病毒Ch T11、Ch T2 1、Ch T4 0的部分基因组做克隆测序 ,经比较发现与其它国内外HEV株ORF2部分相应核苷酸序列同源性在 78.3 81.3% ,Ch T2 1与Ch T4 0的核苷酸同源性为 98.8% ,而Ch T11与前两者的同源性则分别为 89.8%和 90 .2 %。Ch T11、Ch T2 1、Ch T4 0与其它HEV株相应氨基酸序列同源性在 95.8 97.9% ,它们之间的氨基酸同源性则为 10 0 %。系统进化树分析显示 ,这三株HEV可能代表着一新型HEV。 The partial genomes of three sporadic HEV strains Ch T11, Ch T2 1 and Ch T4 0 were cloned and sequenced. The nucleotide sequences of the ORF2 HEV isolates from other domestic and foreign isolates were 78.3 81.3% The nucleotide homology of Ch T2 1 to Ch T4 0 was 98.8%, while that of Ch T11 was 89.8% and 90.2% respectively. Ch T11, Ch T2 and Ch T4 0 shared 95.7% identity with other HEV strains, and their amino acid identities were 100%. Phylogenetic tree analysis showed that these three HEVs may represent a new type of HEV.
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