RNAstructure软件不同版本对FORS-D分析的影响

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目的:研究RNAstructure两个不同版本(4.2和3.6版)对FORS-D分析的影响。方法:以HIV-1CRF01_AE基因组为对象,将其分隔成连续的含200碱基的片段,两个连续片段之间互相重叠150碱基。用序列打乱程序将每个片段打乱成10个碱基组成相同的随机片段。用RNAstructure软件分别计算每个片段核酸二级结构的最小自由能。结果:两个不同版本RNAstructure软件获得的FONS、FORS-M和FORS-D值在基因组上具有完全一致的分布。用Z检验分别比较两组数据的平均值,发现4.2版
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