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农业是我国国民经济的基础，农业综合开发是目前我国支持农业发展的重要举措。自1988年进行农业综合开发项目建设以来，国家投入了大量的资金来促进农业的发展。作为一个农业大国，以后还会有更多的资金进行投入，这使对资金的绩效进行评价显得非常重要，而绩效评价的关键是对指标进行权重设置。层次分析法是在权重设置中被广泛使用的重要方法。文章首先根据一定的原则筛选出绩效评价的指标；然后运用层次分析法确定指标权重。该评价模型对各地农业综合开发土地治理项目资金绩效评价具有较强的实用性，也可为后来的研究提供一定的参考。