基于玛氏骨条藻转录组的脂肪酸合成途径分析

来源 :中国海洋大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：blueblood008

【摘要】

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本研究利用Illumina Hiseq2000对不同生长时期的玛氏骨条藻（Skeletonema marinoi）进行转录组测序，得到的转录本通过NR、NT、Swiss-Prot和KOG数据库进行功能分类，通过GO和KEGG数据

【作者】

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张梅米铁柱甄毓王华龙

【机构】

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中国海洋大学环境科学与工程学院,海洋环境与生态教育部重点实验室,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室,中国海洋大学海洋生命学院

【出处】

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中国海洋大学学报(自然科学版)

【发表日期】

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2018年4期

【关键词】

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玛氏骨条藻脂肪酸合成转录组

【基金项目】

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国家自然科学基金项目(41521064);山东省自然科学基金项目(ZR2014DM007);鳌山科技创新计划项目(2016ASKJ02)资助~~

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本研究利用Illumina Hiseq2000对不同生长时期的玛氏骨条藻（Skeletonema marinoi）进行转录组测序，得到的转录本通过NR、NT、Swiss-Prot和KOG数据库进行功能分类，通过GO和KEGG数据库进行相关代谢途径分析和基因差异表达分析，在此基础上构建了S.marinoi的脂肪酸生物合成途径，发现共存在26种酶和蛋白对应的33个编码基因，对这33个基因序列进行比对发现其与假微型海链藻（Thalassiosira pseudonana）的同源性较高。在该代谢通路中，S.mar

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