【摘 要】
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本研究以东海带鱼转录组测序数据为基础,采用MISA软件进行SSR筛选,利用Samtools和GATK进行SNP筛选,并进行SSR和SNP的特征分析。结果共获得SSR49311个,其中完整的微卫星共有44
【基金项目】
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2017省农林渔业经营与管理体系建设专项资金(浙财农[2016]120号、舟财农[2017]78号);2017年第二批现代渔业发展市级专项补助资金的通知(舟财农[2017]53号);舟山市公益类科技项目(2017C32086)
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本研究以东海带鱼转录组测序数据为基础,采用MISA软件进行SSR筛选,利用Samtools和GATK进行SNP筛选,并进行SSR和SNP的特征分析。结果共获得SSR49311个,其中完整的微卫星共有44625个,复合型SSR数目为4687个。SSR片段长度11~374bp。重复长度小于20bp的序列,有30997条,其中长度在12~20bp的SSR为7523个,约占总数的29.35%,呈中等多态性,重复长度大于20bp长序列为13627个,约占总数的53.18%,呈较高多态性;共获得SNP位点数87619
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