【摘 要】
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为了解华南地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行、变异及进化情况,从该地区的不同猪场采集2 159份样品,利用RT-PCR方法检测PEDV,扩增了部分PEDV阳性样品中的S、M和ORF3基因并测序
【机 构】
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河南农业大学牧医工程学院,广东省农科院动物卫生研究所
【基金项目】
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广东省科技厅项目(2012A020200014,2010A040301010),广州市科技计划项目(12C14071615),广东省生猪产业体系项目(粤农2009-380)
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为了解华南地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行、变异及进化情况,从该地区的不同猪场采集2 159份样品,利用RT-PCR方法检测PEDV,扩增了部分PEDV阳性样品中的S、M和ORF3基因并测序,利用生物信息学软件进行序列分析.结果显示,PEDV在猪场中的检出率为100%,在所有样品中的平均检出率为53.0%,在哺乳仔猪、断奶仔猪、育肥猪和母猪样品中,PEDV平均阳性率分别为67.6%、42.8%、12.8%和47.2%.根据S、ORF3和M基因建立的进化树,PEDV可分为2个基因群,其中当前样品株为一
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