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改革开放30年来,长三角经济圈、珠三角经济圈取得了飞速的发展,已经成为中国经济发展的几个重要的经济增长点。自主创新关系重大,它影响到长三角地区的可持续发展。本文通过收集长三角地区三个省的面板数据,对影响长三角地区自主创新的因素进行了实证分析,结果表明:影响长三角地区自主创新的因素主要有研发资本投入与国内市场需求;而FDI、研发人员投入与出口对自主创新没有显著性影响。