基于网络药理学和分子对接研究丹参-赤芍药对治疗结直肠癌的作用机制

来源 :中草药 | 被引量 : 1次 | 上传用户:lrdg
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 基于网络药理学和分子对接技术探究丹参-赤芍药对治疗结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的作用机制,并进一步运用体外细胞实验进行验证。方法 通过TCMSP数据库筛选出丹参-赤芍药对活性成分及其对应的靶点,通过检索GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库检索获得CRC相关靶点,将丹参-赤芍活性成分靶点与CRC靶点取交集,采用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-疾病-靶点”网络,运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,运用R语言进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;选取关键靶点及核心活性成分,使用AutoDock软件进行分子对接。通过体外细胞实验验证网络药理学结果,分别采用MTT及划痕实验检测丹参-赤芍药对对HCT116细胞增殖及迁移能力的影响,采用qRT-PCR及Western blotting检测丹参-赤芍药对对网络药理学核心靶点表达的影响。结果 网络药理学预测显示,丹参-赤芍药对活性成分206个,共有352个对应的靶基因,CRC疾病相关靶点9143个,得到交集靶点283个。通过PPI网络筛选得到丹参-赤芍药对治疗CRC的关键治疗靶点3个:雌激素受体1(estrogen receptor 1,ESR1)、黏着连接蛋白β1(catenin β1,CTNNB1)和视网膜母细胞瘤基因1(retinoblastoma 1,RB1)。GO功能和KEGG通路分析显示,关键靶点涉及磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、p53信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia-inducible factor-1,HIF-1)、细胞凋亡等。分子对接结果显示关键靶点与重要活性成分结合构象稳定,筛选出丹参-赤芍药对治疗CRC的核心活性成分主要是黄芩苷、芍药内酯苷、苯甲酰芍药苷等。MTT及划痕实验表明,丹参-赤芍药对对HCT116细胞增殖和迁移能力具有明显的抑制作用(P<0.05、0.01);丹参-赤芍药对显著抑制ESR1和CTNNB1 m RNA表达水平(P<0.05、0.01),显著上调RB1m RNA表达水平(P<0.05);显著下调ESR1、β-catenin、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(cystein-asparate protease-3,Caspase-3)和聚腺苷酸二磷酸核糖转移酶(poly-ADP-ribose polymerase,PARP)蛋白表达水平(P<0.05、0.01),显著上调RB1蛋白表达水平(P<0.05、0.01)。结论 丹参-赤芍药对可能作用于ESR1、CTNNB1和RB1等靶点,通过PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、p53信号通路、HIF-1信号通路等相关通路,从而抑制CRC细胞的增殖和迁移能力。
其他文献
非遗文化不仅能够为高校提供丰富的教育资源,而且可以开阔学生的眼界,增强学生的思维能力。该文阐述了非遗文化对于高校艺术设计教育的重要性,分析了厦门珠绣的艺术溯源、生态以及应用价值、美育价值,从教学方式、教学内容、实践活动等方面,探索厦门珠绣如何更好、更有效地融入高校艺术设计教育实践。
期刊
随着时代的发展,人们对建筑质量有了更高要求。在市场竞争日益激烈的背景下,建筑行业需要朝着数字化方向发展,提高项目造价管理水平。相关研究结果显示,在建筑工程造价精细化管理过程中,BIM技术具有较高的应用价值。本文探讨了建筑工程造价精细化管理存在的问题,并提出了基于BIM技术的建筑工程造价精细化管理策略,以期为相关管理人员提供参考。
期刊
基于网络药理学方法分析黄精芡实汤治疗糖尿病前期的分子机制。运用系统药理学方法查找并从中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP,http://Lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)筛选黄精芡实汤方剂中各药材的活性成分及靶点,查找糖尿病前期相关基因,确定黄精芡实汤治疗糖尿病前期的靶点。利用Cytoscape构建"药物成分-靶标"网络,筛选关键化合物。利用STRING建立蛋白质相互作用(p
期刊
目的 研究防己生物碱类活性成分逆转乳腺癌阿霉素耐药潜在的作用机制。方法 首先通过TCMSP数据库对防己生物碱类活性成分进行筛选,采用SwissTargetPrediction数据库在线预测防己生物碱类活性成分潜在靶点,通过GeneCards数据库收集疾病靶点,取交集构建“成分-靶点”和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,然后进行基因本体(g
期刊
随着社会经济的发展,建设项目越来越复杂、越来越系统化。我国传统的工程造价管理方法和目前正在发展的建筑行业的成本管理体系不兼容、落后,严重制约了建筑业的发展。文章着重探讨BIM技术在工程造价精细化的管理具体应用和策略。
期刊
目前旋转机械正朝着高速化、智能化和高性能的方向发展,可倾瓦滑动轴承因具有高负载、低摩擦、运行稳定、可自动调节等特点,得到广泛应用。在高速重载工作环境下,任何早期轴承故障都可能会引发灾难性事故。为保证轴承质量,需要对可倾瓦滑动轴承进行出厂检测,因此研发可倾瓦滑动轴承测试系统对其综合性能检测和研究具有重要意义。本文以高速可倾瓦滑动轴承为研究对象,在本课题组自主研发并已成功用于某飞机附件试车台的高速运转
学位
数字经济时代,场景成为驱动商业生态系统创新演化的新范式,但现有文献并未进行充分揭示。采用纵向案例研究解构产业互联网平台场景创新驱动商业生态系统创新演化的机制。结果表明,场景驱动商业生态系统创新的逻辑基础是“场景洞察—场景创造—场景赋能—网络创新”;场景驱动商业生态系统创新的动态机制是三重嵌入下场景数字化赋能驱动的价值共创主体(生态网络节点)与客体(商业价值和社会价值)创新。结论有助于拓展场景驱动创
期刊
产业互联网平台是新一代信息技术在产业端的集成应用,通过搭建产业服务基础设施,赋能产业内经济体,带动产业整体升级。本文在和谐管理理论的指导下,以欧冶云商为案例,研究了产业互联网平台赋能的关键要素、动态过程及其内在机理。研究发现:产业互联网平台围绕“平台化创新—智慧化运营—生态化协同”阶段性关键任务,以资源为基础,通过技术与人才的互动和耦合,开展“资源开发—资源拓展—资源整合”活动,呈现出“连接赋能—
期刊
<正>近期,雄安新区产业转型升级银企对接会暨产业互联网平台发布会在容城县举行。会上,雄安新区改革发展局主要负责同志宣布雄安新区产业互联网平台正式发布,农业银行成功为首批100家企业注册开通平台账号,并实现首笔基于产业互联网平台的线上贷款投放,标志着雄安新区产业互联网平台成功上线。过去,雄安新区三县传统产业经过长期积累,形成了一批特色产业集群,吸纳了大量就业人口,有力支撑了三县经济社会发展,但也存在
期刊
目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨地骨皮调血脂的作用机制。方法 使用TCMSP数据库并查阅相关文献确定地骨皮活性成分;采用SwissTargetPrediction、GeneCard和OMIM数据库预测地骨皮活性成分靶点和高脂血症相关靶点,应用Venny 2.1取两者交集;运用Cytoscape 3.8.2软件绘制成分-靶点-疾病网络;应用String数据库构建交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用
期刊