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目的
原发性肝癌是一类高发病率、高病死率的消化道恶性肿瘤。早期诊断困难，且术后高复发率和高转移率，预后差，因此从基因水平更好地了解肝癌的发生、发展，为以后基因治疗或靶向药物治疗提供理论基础显得尤为重要。
方法使用TCGA数据库获取肝癌基因转录组数据信息及临床表型信息，利用R语言里edgeR软件包将该转录组数据进行标准化，设定log FC绝对值>1，FDR<0.01的基因为表达差异基因，然后使用加权基因共表达网络分析（WGCNA）方法分析肝癌分期与差异表达基因的关系，寻找关键基因。
结果得到与肿瘤分期相关的关键基因4个（TPX2、HJURP、KIAA1524、SGO2）。通过绘制Kaplan-Meier生存曲线发现，它们的表达水平与患者生存时间显著相关，高水平表达为独立预后不良因素。
结论应用WGCNA的方法，对TCGA数据库信息进行挖掘，发现与肿瘤分期相关的关键基因。其中TPX2、HJURP、KIAA1524与肝癌的关系已有文献报道，但SGO2尚未报道，本研究将为肝癌的后续研究提供重要的理论依据。