近年来,随着我国教育体制改革的不断深化,高等教育事业迅猛发展,办学规模越来越大,这种规模的快速扩张带来了管理的相对滞后和投入资金的不足等问题,为了缓解资金的压力,大部分高校向银行等金融机构申请贷款,由此带来大规模的贷款风险与较为粗放的管理模式之间的矛盾,导致部分高校的财务风险日益增加。文章以高校内部控制的核心问题之一财务风险控制作为研究对象,深入探讨了我国高校财务风险内部控制面临的现状及存在的问题,从内部控制制度的构建、管理流程的规范性和风险防控意识等几个方面阐述了对财务内部风险控制的必要性和可行性,提出为了使高校的财务管理更加规范,保障国有资产安全,向国家培养更多优秀的人才,高校必须制定有效的管理制度和规范的内部控制措施,这对预防经济犯罪、提高组织管理水平、增强组织能力具有非常重要的作用,将一些可以避免的财务风险化解,对防范高校财务风险管理具有积极作用。基于此,有针对性地提出一些完善我国高校财务风险内部控制制度的合理建议,以帮助学校提高财务内部风险控制水平,更好地促进高校在科研教学中的健康发展。