【摘 要】
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解淀粉盐颗菌TNN58(Halogranum amylolyticum TNN58)是一株极端嗜盐古菌,它可以利用葡萄糖积累3HV摩尔分数高达20%的PHBV。首次通过鸟枪法对H.amylolyticum TNN58进行了全基
【机 构】
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江南大学工业生物技术教育部重点实验室,北京联合大学生物化学工程学院,中国科学院微生物研究所
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(21276110),国家973计划项目(2012CB725202),江苏高校优势学科建设工程项目,北京市优秀人才培养资助青年骨干个人项目((2014000020124G064)),111计划(111-2-06),生物质废弃物资源化利用北京市重点实验室开放课题项目
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解淀粉盐颗菌TNN58(Halogranum amylolyticum TNN58)是一株极端嗜盐古菌,它可以利用葡萄糖积累3HV摩尔分数高达20%的PHBV。首次通过鸟枪法对H.amylolyticum TNN58进行了全基因组测序,利用Velvet软件进行组装,得到32个支架序列,整个基因组大小约为4.71 Mb,测序深度为218X。通过对基因组数据进行分析,发现该菌株PHA合酶由phaE和phaC两个亚基组成,存在4条3-HV的供应途径,同时发现该菌株不存在乙醛酸循环途径,但存在甲基天冬氨酸循环途径
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