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本文对RFLP、RAPD、SSR和AFLP四种主要的分子标记在研究多态性时所揭示的信息量进行比较研究，结果表明：(1)SSR标记的多态性最高，多态性信息含量PIC值最大，适于品种指纹图谱绘制、基因型鉴定和核心种质构建。另外，由于SSR标记主要检测基因组的重复区，因此用SSR标记研究功能基因区的差异效果较差；(2)AFLP标记评价效率最高，评价效率指数Ai值最大，在一次扩增中能有上百条带，不但能比较不同样品的相异的带，而且可以从相同的带型及带的多少来比较遗传背景的相似程度，适于研究不同种质问的遗传关系、亲子