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在南海北部陆架和南海南沙西南陆架6个地理位点采集224尾短尾大眼鲷（Priacanthus macracanthus）样品,采用线粒体控制区（mt DNA D-loop区）序列分析了其种群遗传结构,探讨了6个采样位点之间短尾大眼鲷种群归属关系。所得224条同源序列D-loop片段（729 bp）中检测到101个突变位点和94个核苷酸多态位点,定义了172种单倍型;遗传多样性表现出高单倍型多样性（0.980 5-0.997 1）和低核苷酸多样性（0.048 2-0.060 9）的特点;系统发育分析、分子方差