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引起苹果黑点病的主要致病菌仁果柱盘孢Cylindrosporium pomi Brooks的寄主范围较窄，仅对苹果、海棠和花红有致病性。苹果的不同品种对该病的抗病性有一定差异，青香蕉、富士和金冠最为感病，接种病果率分别为90.1%、63.3%和52.0%；国光较为抗病，病果率为17.8%。但果柱盘孢菌丝生长适宜条件为20－25℃，pH5－7；在玉米粉和燕麦培养基上产孢量大。分生孢子萌发适温为15－25℃，湿度达98％以上萌发较好，在蒸溜水中萌发率可达70％,葡萄糖和果糖液可提高萌发率。