快速检测结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药相关基因mPCR-SSCP建立及应用

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangtongqc
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读

目的 建立快速检测结核分枝杆菌异烟肼(INH)和利福平(RFP)耐药相关基因katG、inhA和rpoB突变的多重聚合酶链反应-单链构象多态性(multi PCR-single strand conformational polymorphism analysis,mPCR-SSCP)方法.方法 药敏试验检测134株结核分枝杆菌临床菌株对INH和RFP的耐药性.设计结核分枝杆菌INH和RFP耐药相关katG、inhA和rpoB基因PCR引物,建立mPCR-SSCP技术检测上述菌株katG、inhA和rpoB基因的突变,同时采用PCR直接测序技术(PCR-DS)检测上述基因片段突变情况,并对上述3种方法检测结果进行分析和比较.结果 134株临床菌株均含有katG、inhA和rpoB基因,其中42株(31.3%)对INH耐药、45株(33.6%)对RFP耐药.mPCR-SSCP和PCR-DS检测结果显示,92株INH敏感菌株katG和inhA基因均未发生突变,检测特异性均为100%;89株RFP敏感菌株中rpoB基因分别有2株和1株检测出突变,检测特异性分别为97.8%和98.9%;42株INH耐药菌株中分别有33株和36株katG和/或inhA基因突变,检测灵敏度分别为78.6%和85.7%;45株RFP耐药菌株中rpoB基因分别有41株和43株发生突变,检测灵敏度分别为91.1%和95.6%.结论 本研究建立的mPCR-SSCP能快速、简便、特异,并有一定的敏感性检测结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药相关基因katG、inhA和rpoB突变,具有临床应用前景。

其他文献
生殖道解脲支原体(Ureaplasma urealyticum,Uu)感染是人类生殖道疾病最常见、多发的病原体之一,解脲支原体感染可引起男性泌尿道感染,女性生殖道炎症、盆腔炎等,严重者可引起男女不孕不育[J].早期诊断对解脲支原体感染的治疗有着深远意义.目前实验室检测多以培养和荧光定量PCR为主,而培养需要48 h,同时对标本的采集、运输有较高的要求,不适合于快速诊断.荧光定量PCR技术可以在2h
期刊
近年来,随着对慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉(chronic rhinosinusitis with polyps CRSwNP)研究的深入,与变应原因素相关的炎症反应在CRSwNP中越来越受到关注.本报道在CRSWNP患者CC趋化因子受体6(CC chemokine receptor 6,CCR6)的表达与疾病相关性的研究中,发现CRSwNP患者黏膜的CCR6表达增加,可能在疾病的发展中发挥重要作用。
期刊
目的 研究TIM-3、TIM-1、T-bet、GATA-3、IFN-γ、IL-4和Galectin-9基因在Graves病(GD)患者外周血的表达及其临床意义.方法 通过实时定量RT-PCR分别检测70例Graves病患者及22例健康正常人外周血单个核细胞(PBMC)中TIM-3、TIM-1及其相关基因mRNA的表达情况,并分析TIM-3、TIM-1与其之间的关系.结果 GD患者PBMC中TIM-
原发性肝细胞癌是严重危害人类健康的恶性肿瘤之一,发病率日益增高,且预后较差,生存率低。大部分肝癌患者由于转移或者肝功能恶化不适合手术治疗,非手术治疗如化疗、介入治疗等虽然能够减少肿瘤负荷,提高生存率,但肿瘤复发却很常见。近年研究表明,通过抑制免疫效应细胞对肿瘤发生免疫应答,在促进肿瘤的发生、发展中起一定的作用。
期刊
目的 研究多发性骨髓瘤(MM)细胞中丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路的表达及活化情况,探讨MAPK信号通路对MM细胞B淋巴细胞刺激因子(BLyS)表达变化的影响及对MM细胞增殖与存活的影响,并初步探讨MAPK信号通路在IFN-γ(MM重要的促生长因子)上调MM细胞BLyS表达过程中的作用.方法 应用Western blot方法检测MM细胞中蛋白ERK、p-ERK、JNK、p-JNK、p38及
微小RNA(microRNA或miRNA)是近年来新发现的一类小RNA分子.自1993年Lee等用经典的定位克隆方法在线虫(Celegans)体内发现首个microRNA( Lin-4)以来,迄今已发现约16772个microRNA(miRBase数据库17版,http://microrna.sanger.ac.uk/sequences),成为目前已知最大的基因表达调控家族.microRNA广泛存
期刊
目的 研究中国汉族人群中核因子-κB受体激活因子配体(receptor activator of NF-κB ligand,RANKL) rs7984870基因多态性与类风湿关节炎(RA)发生危险因素关系.方法 采用以医院为基础的病例-对照研究,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱( matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight
细菌素(bacteriocin)是细菌在代谢过程中由核糖体合成基因编码的一类具有生物活性的多肽或蛋白质类物质。与抗生素相比,细菌素具有靶向性强、安全和不容易产生耐药性等优点。近年来,研究发现苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)可产生不同大小的具有抑菌作用的细菌素[1]。本研究旨在寻找安全、高效、具备应用潜力的新型细菌素,探讨苏云金芽孢杆菌4AJl细菌素对单核细胞增多
期刊
目的 测定汉坦病毒S基因编码区序列,分析和预测其编码的核蛋白结构,用于指导汉坦病毒诊断性抗原的筛选.方法 对免疫荧光技术(IFA)阳性的鼠肺组织应用RT-PCR法扩增汉坦病毒S基因完整开放读码框(ORF),扩增产物克隆到pGM-T载体,转化E.coli TOP10,通过蓝白斑试验和PCR筛选阳性克隆后进行基因序列测定;利用NCBI和Swiss-Prot/TrEMBL数据库中相关基因与蛋白结构分析软
目的 观察AIM2( absent in melanoma 2)在感染早期识别胞浆小鼠巨细胞病毒(MCMV) DNA的变化状况.方法 建立MCMV全身播散型感染模型,接种MCMV Smith株后第1、3、5和7天各处死3只小鼠;同时设模拟感染小鼠作为正常对照.Western blot检测脾脏巨噬细胞中AIM2、衔接子凋亡相关点样蛋白(ASC)和caspase-1蛋白的表达状况;同时应用ELISA法