目的针对Cpn0308基因建立检测肺炎衣原体的Taqman探针实时荧光定量PCR（FQ-PCR）方法。方法根据肺炎衣原体包涵体膜蛋白Cpn0308基因序列设计引物和Taqman探针,建立Taqman FQ-PCR检测体系,对反应体系进行优化,进行灵敏度、特异性、重复性评价;并与商品化肺炎衣原体核酸检测试剂盒检测临床标本进行对比分析。结果肺炎衣原体Taqman FQ-PCR方法的引物浓度300 nmol/L,探针浓度200 nmol/L,Mg²⁺4.0 mmol/L为最优反应条件;灵敏度为8.36×102copies/μL;该法对常见几种呼吸道病原菌及沙眼衣原体无交叉反应;重复性试验中4个浓度变异系数均小于3%。自建方法与商品化试剂盒对呼吸道感染组、心血管疾病组及正常对照组标本检出率分别为10%vs 10%（χ²=0.167,P>0.05）,44.44%vs 40.74%（χ²=0,P>0.05）,6.67%vs 3.33%（χ²=0,P>0.05）,各组阳性率间差异无统计学意义;2种方法的总阳性率（16.54%vs 14.96%）比较差异无统计学意义（χ²=0.071,P>0.05）。结论本研究建立的Taqman探针实时荧光定量PCR检测肺炎衣原体的方法灵敏度好,特异性高,重复性好,可应用于临床肺炎衣原体核酸检测。