南沙保税港区在海关监管方面将按照一线放开、二线管住、区内自由、进区退税的原则，对全区域进行封闭化、信息化、集约化、简约化的监管。
　　
　　广州南沙保税港区于7月9日顺利通过国家11个部委联合验收，即将正式封关运作，成为广东省首个通过国家联合验收组验收的保税港区，是目前珠三角乃至泛珠三角地区对外开放层次最高、政策最优惠、功能最齐全、区位优势最明显的特殊功能区域。广州海关副关长谢建年表示，广州海关将依托南沙保税港区，综合运用保税物流、保税加工、监管通关等政策和功能，充分运用信息化技术手段，实现大港口与大腹地联动、大工业与大物流联动、海港与空港联动、水陆与陆路联通，推动区域经济和周边产业发展。
　　南沙保税港区享有保税区、出口加工区、保税物流园区等各类海关特殊监管区域的功能优势和区位优势，具有国际中转、国际配送、国际采购、国际转口贸易和出口加工等功能。它将现阶段各类特殊监管区域功能进行完美组合。通过保税物流产业和临港增值加工业，增强港口的物流集聚效应．适应航运、港口和现代物流一体化发展趋势。吸引国际中转、国际配送和临港增值服务等高附加值业务向我国转移，提升港口国际竞争力；保税港区完备的保税物流、保税加工功能，可满足跨国公司普遍采用的零库存、即时生产等现代生产方式、管理方式和营销方式，使保税加工、保税物流在港区内同步协调发展，以区促港。以港兴区，促进加工贸易转型升级和对外贸易增长方式的转变。
　　谢建年表示，珠三角尤其是珠江西岸企业将成为最大的受益者。南沙保税港区可以享受包括国外货物入港区保税，国内货物入港区视同出口享受退税，港区内企业之间的货物交易不征收增值税和消费税等。既为企业降低运营成本、加快资金周转速度、应对金融危机提供支持，也将促进完善陆路交通和江海、空海联运，将使珠三角尤其是珠江西岸企业的物流成本大大降低。
　　据了解，南沙保税港区在海关监管方面将按照一线放开、二线管住、区内自由、进区退税的原则，对全区域进行封闭化、信息化、集约化、简约化的监管。即：一是港区管理的封闭化，以确保政策的有效发挥。二是通关监管信息化，海关将对区内企业进行计算机联网管理，并与区内相关管理部门实现电子联网，提高通关效率。三是海关集约化，海关建立统一管理机构，以统一的监管模式统筹相关业务。四是手续简约化，对区内货物实行电子报备管理，区内货物不征收关税，自由流动。
　　广州海关将通过创新管理机制、简化作业流程、提高管理效能。对出口加工区、保税物流园区、港口作业区三个功能区之间货物流转，采取“卡口+专用车辆+电子关锁+GPS”监管方式，实施有效的卡口和途中监管，实现货物便捷快速流转，做到“一次申报、一次查验、一次放行”，为企业发展创造良好运作环境．引导高端制造业以及现代物流业、贸易、金融、信息、研发、设计等辐射集聚效应强的服务行业入区，承接国际现代服务产业转移，打造主体功能突出的区域性现代制造、服务业中心。
　　另据谢建年介绍，由于全球金融危机影响，很多外贸企业因国外客户取消订单，成品无法按期出口，但加工贸易手册又将到期核销，如将货物存在境外仓库，不但仓储费用高，还要二次配送。面对这两难境地，外贸企业可利用“国内货物进入保税港区视同出口”这一政策和功能优势，将货物报关出口存入保税港区，这样既可迅速办理出口退税．盘活资金．又解决加工贸易手册到期核销、避免货物在境外仓储费用高、二次配送等问题。
　　企业在进口方面，可利用“入保税港区保税”的政策和功能优势，利用国际市场价格走低的机会，以保税仓储方式大量进口战略性、资源型物资，增强市场竞争力。
　　谢建年表示，随着建设和功能的逐步完善，南沙保税港区还将发挥其商品展示和仓储的独特优势，与广州广交会琶洲展馆相互呼应，形成“前展后仓”的格局，中国进出口商品交易会将变身永不落幕的“广交会”。