基于MALDI-TOF核酸质谱的猪呼吸道病毒多目标鉴定方法的建立和应用

来源 :微生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tianjinajun
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
【目的】建立能高效同步鉴定猪伪狂犬病毒(PRV)、猪圆环病毒2型(PCV-2)和3型(PCV-3)、非洲猪瘟病毒(ASFV)以及猪博卡病毒1型(PBoV-G1)、2型(PBoV-G2)和3型(PBoV-G3)等呼吸道病毒的核酸质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)高通量多目标检测技术。【方法】根据7种病原体基因的保守序列,分别设计不同病原的引物及对应单碱基延伸探针,通过引物浓度和反应条件优化,方法特异性、敏感性和稳定性分析,以及临床样本和猪源产制品的检测验证,建立了常见猪呼吸道DNA病毒的MALDI-TOF MS多目标检测体系。【结果】质谱分析显示,多目标检测体系的7种靶标产物峰只在特定病毒阳性样品检测时产生,与其他病原体检测无交叉反应,表明该方法对7种靶标病毒检测特异性良好。重复性试验结果分析显示,体系中每种病毒在高、中、低浓度时批内阳性符合率均≥98.0%,批间均≥98.3%,表明该方法具有较高的稳定性。体系中7种病原体每种病毒最低检测限在8.65–26.27拷贝/μL之间,与荧光PCR检测方法相当。采用MALDI-TOF MS多重检测方法对100份组织、饲料和猪肉样品进行检测应用,检出两种及以上混合感染样品39份,其中5份样本同步检出5种病原体阳性;对8份ASFV-p72假病毒人工污染样品进行验证,均可检出ASFV阳性。将以上样本检测应用结果与荧光PCR方法分析结果进行比对验证,两种方法对于不同病原体检测结果的符合率高达94.4%–100%。【结论】本研究建立的基于MALDI-TOF MS的猪呼吸道常见DNA病毒多重检测方法为猪群相关疫病快速监测和鉴别诊断,以及便利化进出口动物检疫等提供了一种新的敏感、特异的高通量多目标检测技术。
其他文献
2018年11月5日,习总书记宣布在上海证券交易所设立科创板并试点注册制;2019年3月2日,证监会联合上交所发布设立科创板并试点注册制的配套业务指引,标志着科创板注册制正式落地;6月13日,科创板在上海证券交易所正式开板,一个多月后,首批25家科创公司上市。短短半年多时间,科创板已完成从宣告到制度设计再到正式开板全过程,截止2020年2月,已有89家公司在科创板上市。科创板的火速上线意味着我国资
目的 建立气相色谱-串联质谱法测定咖啡及其制品中3种糠醛类化合物的检测方法。方法 样品采用乙醇-水(1∶2,V∶V)溶液提取,10%Na2CO3溶液超声5 min, 100 mg C18、50 mg强阳离子交换剂(srong cation exchang, SCX)、150 mg无水MgSO4净化,采用HP-INNOWAX毛细管柱(30 m×0.25 mm, 0.25μm)分离,气相色谱-串联质谱
期刊
目的了解2013年海盐县诺如病毒流行株基因型谱分布。方法 2013年收集170例腹泻患者粪便标本,利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测诺如病毒核酸,挑选部分毒株进行核苷酸序列测定并构建系统进化树。结果检测170例腹泻患者粪便标本,诺如病毒阳性24份,检出率为14.12%;其中诺如病毒GⅠ基因组1份,占4.17%,序列测定为GⅠ.2基因型;GⅡ基因组23份,占95.83%,选4株进行序列测定
历史纪录片将镜头对准过往的人、事、情,其“纪实性”与“再现性”承载着厚重的中国故事,“影像性”与“共情性”创造出雅俗共赏的魅力,从而决定了历史纪录片讲好中国故事的重要意义。文章系统总结出了历史纪录片讲好中国故事的优势特征,提出了当前历史纪录片存在的问题,继而从讲好中国故事的角度提出了历史纪录片叙事策略,从崭新视角审视历史纪录片创作与传播价值,为此类纪录片更好地策划和创作提供有益的建议和对策。
花青素还原酶(anthocyanidin reductase,ANR)是原花青素生物合成途径中的关键酶之一,同时,ANR通过调节植物不同组织中花青素的积累影响植物对光的吸收程度和叶面温度,提高茶树的防御力和对环境的适应性。利用生物信息学分析方法,从‘舒茶早’基因组数据中鉴定出茶树ANR基因家族成员,并分析ANR家族成员的基因结构、蛋白理化性质、保守基序及顺势作用元件。结果表明,CsANR家族有21
针对铅芯橡胶隔震支座在长周期长持时地震作用下由于铅芯温度上升发生力学性能退化的问题,通过压剪设备对铅芯橡胶隔震支座进行了快速水平往复力学性能试验,研究其在快速往复加载下水平剪切力学性能的变化。试验结果表明,铅芯橡胶隔震支座在快速往复荷载作用下,随着加载次数的增多,其特征强度显著下降,且前期下降的幅度比后期大,屈服后刚度在加载过程中变化较为平缓。然后基于试验结果,采用改良的广义Bouc-Wen模型,
近年来,随着数字技术和媒介融合的发展,纪录片焕发新活力。借助新媒介创作思维和HDR、杜比音效技术,业界关于纪录片真实性的表达有了新的延展。文章以纪录片《众神之地》为例,论述纪录片在创新发展路径上的新感官体验、新美学风格和新发展趋势,为融媒体时代纪录片的高质量发展提供参考。
CFG桩作为软土地基处理的一种方式,广泛应用于沿海地区公路的施工,具有明显的经济效益和使用效果。在莆田市荔城大道-荔园路立交桥建设工程中,CFG桩采用振动沉管法施工,严格按照施工要点开展工作,不仅要控制拌合料质量、桩位偏差、垂直度,还要抓好跟踪量测和整桩质量检测工作。