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通过对资本自由度与区域创新绩效问的影响关系进行实证研究，发现资本自由度对区域创新绩效有着很显著的促进作用，在区域创新绩效不同的地区，资本自由度对区域创新绩效的影响机制呈现阶段性特征。通过进一步深入研究发现，政府及制度因素、经济因素、货币供给及金融发育程度对创新绩效有着正向的影响，而金融市场化水平对创新绩效的影响机制还不是很明确，有待我国金融市场的进一步改革，这种正向影响才会凸显出来。