2013—2015年安庆地区腺病毒流行株型别鉴定及六邻体基因特征分析

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:vitchen02
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目的

了解引起安庆地区急性呼吸道感染的人类腺病毒(HAdv)流行株型别特点及编码六邻体蛋白基因及氨基酸残基的变异情况。

方法

收集2013—2015年间流感监测哨点596份急性呼吸道感染患儿咽拭子,real-time PCR腺病毒核酸检测试剂盒进行检测,阳性标本进行Hep细胞病毒分离,对病毒分离成功样本进行六邻体蛋白基因(hexon gene)PCR扩增、测序并将序列与GenBank发表的序列进行同源比对和进化树分析。

结果

HAdv阳性标本68份,阳性率为11.4%。病毒分离成功34株,其中,HAdv-3型为9株占26.5%;HAdv-7型为12株占35.3%;HAdv-14型为12株占35.3%;HAdv-55型为1株占2.9%。9株HAdv-3型分离株与KX384958亲缘关系最近,为99.8%~100%,与其他株相比较氨基酸残基的变异主要有3个;12株HAdv-7型分离株与KX897164和KU361344亲缘关系最近,为99.8%~100%,与其他株相比较氨基酸残基的变异主要有7个;12株HAdv-14型分离株与JF420883亲缘关系最近,为99.6%~99.9%,与其他株相比较氨基酸残基的变异主要有3个;1株HAdv-55型分离株与KP279748和KX289874亲缘关系较近,核苷酸和氨基酸的同源性为100%。在这几个型别的研究株中HAdv-7型变异最大,其次为HAdv-14型。

结论

2013—2015年,引起安庆地区急性呼吸道感染的腺病毒流行株主要为HAdv-3型、HAdv-7型、HAdv-14型,同时存在少量HAdv-55型。HAdv-55型分离株六邻体基因稳定,没有出现变异。而HAdv-3型、HAdv-7型、HAdv-14型型别之间,核苷酸和氨基酸均发生不同程度的变异。在抗原决定簇HVR1、HVR2和HVR7区存在氨基酸的变异。

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