【摘 要】
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猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)作为一种新型的猪肠道腹泻病毒,建立快速有效的检测手段十分必要。本研究根据PDCoV N基因中的保守序列设计了1对特异性引物,PCR扩增后克隆至pEASY-Blunt Zero载体,构建了阳性质粒pEASY-PDCoV/N。以阳性质粒pEASY-PDCoV/N为模板,建立了检测PDCoV的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法,并对其敏感性、特异性和重复性等进行了优化
【基金项目】
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上海市科技兴农项目[沪农科推字(2021)第1-6号]; 国家“十三五”重点研发项目(2018YFD0500102);
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猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)作为一种新型的猪肠道腹泻病毒,建立快速有效的检测手段十分必要。本研究根据PDCoV N基因中的保守序列设计了1对特异性引物,PCR扩增后克隆至pEASY-Blunt Zero载体,构建了阳性质粒pEASY-PDCoV/N。以阳性质粒pEASY-PDCoV/N为模板,建立了检测PDCoV的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法,并对其敏感性、特异性和重复性等进行了优化与验证。结果显示,Ct值与标准模板在5.83×10~7~5.83×10~1copies/μL范围内呈良好的线性关系,相关系数(R~2)为0.999,线性方程的斜率为-3.323,最低检测限度为5.83×10~1copies/μL。该方法特异性和重复性均较好,对PEDV、PRV、TGEV等病毒均未出现检测信号,批内和批间变异系数分别小于1%和2%。利用建立的PDCoV荧光定量PCR检测方法对60份猪腹泻样品进行核酸检测,阳性率为18.3%,比普通PCR检出率高6.7%。结果表明,该方法可适用于临床快速检测PDCoV,为该病的预防和控制提供技术支持。
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