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高等教育活动的复杂性和高等教育研究的不成熟现状使多学科研究成为高等教育研究的一个非常必要和重要的方法。但多学科研究也应在维护学科的独立性、促进学科之间的整合性和加强学科理论的严密性上深刻反思,通过加强学科制度建设和学科文化的养成,以期望在多学科研究方法的运用中高等教育研究能健康良性的发展。